Η ηρωίδα, Yui Kusanagi, έχει αναλάβει τον ναό Shinto που χρόνια υπηρετεί η οικογένεια της, ανακαλύπτει όμως στην αποθήκη ένα μυστήριο σπαθί που την ταξιδεύει σε έναν διαφορετικό κόσμο όπου συναντά τον Έλληνα Θεό Zeus (Δία). Την προσκαλεί να γίνει μέλος του σχολείου του σε έναν ξέχωρο κόσμο που δημιούργησε. Ο Zeus σκοπεύει να διδάξει το νόημα της αγάπης στα νέα θεϊκά όντα που βρίσκονται επίσης στο ίδιο σχολείο με σκοπό να αποτρέψει την αποδυνάμωση του δεσμού των Θεών με τους Ανθρώπους.