Ο γνωστός ως ο πιο ταχύτερος μπλε σκαντζόχοιρος, Sonic, με τους φίλους του και την κοπέλα του, Amy Rose, και μαζί τους οι γνωστοί Tales και Knuckles ταξιδεύουν στον άλλον κόσμο εξαιτίας της ένωσης των Κρυστάλλων του Χάους από τον κακό καθηγητή και επιστήμονα και τρελό εφευρέτη, Dr Robotnik (Eggman) και τα τσιράκια του. Αποστολή λοιπόν του Sonic και των φίλων του και των δύο κόσμων είναι να μαζέψουν όλους τους Κρυστάλλους του Χάους για να επιστρέψουν όλοι στον κόσμο που ανήκουν προτού η Γη καταστραφεί εξαιτίας της χρονομεταφοράς και των 2 κόσμων και να σταματήσουν τα σχέδια του κακού Dr Robotnik στο να κυριαρχήσει τον κόσμο του νεαρού Chris Thorndyke. (Τα επεισόδια 1,10,14,15,17,20 από την σεζόν 1 και τα επεισόδια 1,10,15 από την σεζόν 2, δεν υπάρχουν πουθενά)